2020年3月，教工党支部薛伟伟同志课题组在《Physical Chemistry Chemical Physics 》核心期刊上发表了题为“The binding mode of vilazodone in the human serotonin transporter elucidated by ligand docking and molecular dynamics simulations”的研究论文。

重度抑郁症(major depressive disorder，MDD)是一类严重的心理健康疾病，是由于社会、心理、生物学和遗传等多方面因素所引起的一种情绪性功能障碍，患者会出现持续性的情绪低落症状，极度严重者甚至会出现自杀行为。维拉佐酮（Vilazodone）作为一种治疗重度抑郁症的新型药物，其主要作用机制是抑制人类五羟色胺转运体（hSERT）并部分激动5-HT_1A受体。Vilazodone与5-HT_1A受体之间的相互作用已有报道，但其在hSERT上的结合方式尚不明确。为了阐明Vilazodone与hSERT结合的分子机理，研究其结合特点，将该药物及其5个类似物与hSERT蛋白晶体进行分子对接得到结合初始构象，并通过400ns分子动力学模拟对6个研究体系进行构象采样。通过蛋白-配体结合自由能分析，作用指纹图谱分析，以及构象重排分析，揭示了Vilazodone与hSERT的相互作用构象。

通过分析，发现与经典抗抑郁药物如西酞普兰（主要作用于hSERT S1位点）的结合方式不同，Vilazodone在作用口袋中呈线性姿势，其芳基哌嗪片段与Y95，D98，I172，Y176，F335，F341，S438和T439相互作用，占据中心位点（S1），吲哚片段通过与离子开关（R104/E403）相互作用延伸到变构位点（S2）（图1）。本研究所得结果不仅有助于了解与hSERT与Vilazodone的结合方式，而且对发现新型抗抑郁药也提供了有价值的指导。

图1 （A-F）维拉佐酮及其类似物代表性构象与含西酞普兰蛋白晶体的空间叠合; （G-H）维拉佐酮与西酞普兰作用构象比较。

该研究得到了国家重点研发项目、国家自然科学基金、中央高校基本科研专项资金等项目支持。

论文链接：https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2020/CP/C9CP05764A#!divAbstract

责任编辑：杨静怡